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什么是「ATAC-seq 技术」？现在用于哪些生物学研究？ - 知乎
ATAC-seq程序的优化也已广泛用于神经组织和生物样本库中的细胞。 ATAC-seq可以测量低至500个细胞的样品，但是它无法在单细胞水平上破译细胞之间的差异。单细胞测序技术的出现使我们能够了解更精细的单细胞水平活动。
什么是「ATAC-seq 技术」？现在用于哪些生物学研究？ - 知乎
atac思路：通过tn5转座酶（在染色质开放区域各种切割，形成复合物后插入到靶序列）来富集开放染色质的dna序列，pcr扩增后ngs测序。官方一点的话：DNA转座，是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象，由DNA转座酶来实现。
atac-seq和chip-seq的区别？ - 知乎
ATAC-seq（Assay for Transposase – Accessible Chromatin with highthroughput sequencing），通过Tn5转座酶将测序接头插入染色质的开放区域，然后通过测序数据来推断染色质区域的可接触性，并计算转录因子结合位点和核小体的区域位置。
ATAC 或 chip-seq中peak 图，下方基因位置中方框、箭头代表什么意思？ - 知乎
对每个区域进行ATAC-seq peaks检测。首先比较了多个大脑区域之间共有的可重复peaks基因组特征分布。发现区域特异性peaks通常分布基因间或内含子区域。同时，更保守的ATAC peaks倾向于在启动子中富集。在所有共有peaks中，只有7 4%在所有6个区域开放。
分析单细胞atac数据比较全面的工具是只有archar和signac麽？ - 知乎
SnapATAC ：151次 Fang R, Preissl S, Li Y, et al Comprehensive analysis of single cell ATAC-seq data with SnapATAC[J] Nature communications, 2021, 12(1): 1-15 ArchR的第一通讯 William Greenleaf 是ATAC-seq技术（【1】）的主要创造者；早在2015年，Greenleaf团队就将ATAC推广到了单细胞水平并且做了很漂亮的
利用HiC数据和ATACseq数据怎样鉴定增强子？或者有相关的文献嘛？ - 知乎
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ATAC-seq质量分析该如何分析，给出的fragment图与标准图相比明显有差异但是具体的原因不知？ - 知乎
ATAC-seq作为表观组学研究技术之一，已经被很多组学专家所接受并已经在应用，那关于ATAC-seq技术，你了解多少呢？要介绍ATAC-seq，不得不提到它的发展史。在染色质开放性研究领域，也是走了一段长长的路，这也是一条长江后浪推前浪的路。
这种热图怎么看啊，求大神们解惑？ - 知乎
就是不同条件下，相关修饰和染色质开放程度(atac-seq)的水平比较。每一个柱子(不知道是不是恰当)的一条横线表示一个基因，中间表示TSS，颜色表示read映射到该位置的强度。为什么会中间深两侧浅，看下图。